Por el sostenido crecimiento de Puerto Varas, Natalio Lastarria, intendente de Llanquihue de la época, donó un amplio terreno a la comunidad católica del lugar, la que acordó dedicarlo al Sagrado Corazón de Jesús, construyéndose un templo por iniciativa del primer párroco del lugar, Juan Evangelista Mellwig. En 1911, dicha estructura sufrió un incendio. Posteriormente, un nuevo párroco jesuita, Cristián Harl, adquirió otro terreno y promovió la construcción del actual templo. La actual parroquia, de estilo neorrománico y barroco, fue construida entre los años 1915 y 1918 por el conocido y prolífero constructor de ese entonces: Edmundo Niklitschek y contó con la colaboración de Bernardo Klenner y Adalio Morales. Su estructura fue fabricada usando ulmo y roble. Los revestimientos interiores son de mañío y laurel.